转录调控生物信息云分析讲座

  • 发布时间:2017-10-31
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转录调控生物信息云分析讲座

在高通测序盛行的今天,面对海量的测序数据,如何进行处理及标准分析,如何从海量的数据中快速找出具有生物学意义的数据,如何将这些数据结果进行图表的绘制,本次讲座将会对这些困扰您的难题进行详细的解读,保证让您满载而归!

时间:2017年11月1日上午9:00开始

地点:图书馆四楼会议室

讲座课程安排: 


9:00-10:00

科技服务2.0时代

什么是百迈客云,百迈客云总体介绍、物种套餐等

10:00-10:20

经典信息分析方法

基于Linux与大型专用服务器的信息分析方法

10:20-10:50

转录组信息分析流程之数据质控

1.转录组-莫着急分析,先看质控结果(总述)没质控的结果谁敢用?

2.质控结果-测序准确性 Q30

3.质控结果-比对效率(有参)异常原因及解决方案

4.质控结果-组装质量评估(无参)

5.质控结果-插入片段长度分布

6.质控结果-随机性分布

7.质控结果-测序饱和度评估

非编码RNA数据质控

1.质控结果-sRNA片段核糖体比例

2.质控结果-sRNA片段长度分布

3.质控结果-sRNA碱基偏好性分布

10:50-12:00

转录组信息分析流程之报告解读

1.表达定量-reads  count tpm rpkm fpkm 如何选择

2.差异分析-fc 为什么总是2?能调吗

3.差异分析-Fdr的含义?能调吗

4.差异分析-生物学重复与技术重复

5.差异分析-生物学重复的意义

6.差异分析- 生物学重复结果怎么解读?

7.差异分析-到底需要几个生物学重复

8.基因注释-依次介绍7个数据库,重点Nr go kegg

9.基因注释-注释结果不一致,如何选择?

10.富集分析-什么是富集,怎么用?

非编码RNA分析流程

1.sRNA鉴定、分类

2.miRNA预测

3.miRNA靶基因预测及功能注释

4.lncRNA鉴定和预测

5.lncRNA靶基因预测及功能注释

14:00-15:30

基于(百迈客云)主流程分析及转录组数据深度挖掘

1.转录组、小rna、lncrna主流程分析

2.表型相关关键基因分析

3.样本间维恩图绘制

4.样本间共有基因分析

5.样本间特有基因分析

6.差异基因集调整及筛选

7.不同组合差异基因间维恩图绘制

8.共表达趋势分析

9.转录因子分析

10.PCA分析

11.WGCNA分析

15:50-16:20

基于公共数据的转录组数据实验设计及深度挖掘

随着测序数据爆炸式增长、测序价格急剧下降,科研工作者面临的问题不再是价格因素,而是如何高效地利用数据。nature  reviews  genetics报道称,目前已发表的高通量测序数据利用率不足20%,很多有价值的信息被研究者所忽略,基于公共数据挖掘和分析将成为科学研究发展的趋势。

16:20-17:00

序列比对、基因注释、图表绘制免费工具使用

具体介绍序列比对、基因注释、图表绘制等工具使用